در حال حاضر، تولید صنعتی نسل اول سوختهای زیستی(بیودیزل، بیواتانول و بیوگاز) به میزان بهینه ای رسیده است. تولید سوخت از منابع باکیفیت پایین (نسل دوم سوختهای زیستی)، راه پایداری برای تامین سوخت و انرژی در بخشهای صنعتی محسوب میشود. سالانه در ایران بیش از 15 میلیون تن ضایعات کشاورزی تولید می شود، در حالی که فقط 0.7 درصد از مصرف انرژی سالانه ایران از زیست توده تولید می گردد. در این مقاله روش فیشر- تروپش به عنوان راهی برای تولید بیودیزل از زیست توده مورد بررسی قرار گرفته است. قیمت نهایی هر لیتر محصول بیودیزل بین 23000 تا 40000 ریال تخمین زده شده که با بهینه سازی فرآیند یا ترکیب کارخانه های زغال سنگ و زیست توده، کاهش خواهد یافت. همچنین، با کاهش میزان انتشار دی اکسید کربن، این فرآیند به روشی سازگار با محیط زیست تبدیل خواهد شد.